Lübeck hoch 3 ist aus einer gemeinsamen Idee der Musikhochschule Lübeck, der Technischen Hochschule Lübeck und der Universität zu Lübeck entstanden. Die Präsidentin der Technischen Hochschule, der Präsident der Musikhochschule und die Präsidiumsbeauftragte (und ehemalige Präsidentin) der Universität zu Lübeck bilden das höchste Entscheidungsgremium von Lübeck hoch 3, das Board. Es ist für die strategische Ausrichtung von Lübeck hoch 3 verantwortlich und entscheidet über die Annahme von Projekten.